Baik-baik Saja mengusung tema tentang proses seseorang saat mulai dewasa dan perlahan sadar kalau orang tuanya juga semakin bertambah usia. Lagu ini menggambarkan rasa takut kehilangan orang tua sekaligus kenyataan bahwa anak sering tanpa sadar mewarisi sifat mereka, termasuk kebiasaan memendam rasa kecewa sendiri.
Di liriknya, sang anak menyadari kalau dirinya punya banyak kemiripan dengan orang tuanya, baik dari sikap maupun cara menghadapi masalah. Salah satunya adalah terbiasa menyimpan rasa sedih atau kecewa tanpa banyak bicara. Semakin dewasa, muncul juga rasa cemas dan ketakutan suatu hari harus berpisah dengan orang tua.